Rize Bağımsız Milletvekili Yılmaz, geçen ay AP'deki Yeşiller Grubu'nun düzenlediği toplantıda Lagendijk'a Müslüman ülkelerde daha saldırgan bir laikliğin olması gerektiğini söyleyerek, "Çünkü İslam daha saldırgan ve elini kaptırırsan kolunu ister." demiş. Star Gazetesi'ne konuşan Joost Lagendijk, söz konusu toplantıda Yılmaz ile Türkiye ve laiklik üzerine tartıştıklarını anlattı. Lagendik, Yılmaz'ın, "Müslüman ve Hıristiyan ülkelerdeki laiklik farklı. Hıristiyan ülkelerde saldırgan laiklik konusunda haklı olabilirsiniz; ama biz Müslüman ülkelerde yaşayanlar laiklik konusunda daha saldırgan olmalıyız, çünkü İslam din olarak daha saldırgan." yorumunda bulunduğunu belirtti. Yılmaz'ın sözlerine katılmadığını ifade eden Lagendijk, "Artık 1923'lerin Türkiye'sinden bahsetmiyoruz, modern Türkiye, laiklik anlayışında hafif değişiklikler yapmak için yeterince güçlü ve yeterince laik." diye konuştu. Avrupa'da pek çok kişinin Türkiye'nin reformlar çerçevesinde farklı bir laiklik anlayışına girmesi gerektiği görüşünde olduğunun altını çizen Lagendijk, "AB, bu sürecin kontrolden çıkmaması için en büyük garanti." dedi.

Yılmaz, AP'deki toplantıda parti kapatma uygulaması ile askerin müdahalesini de savunmuştu. Yılmaz, şunları söylemişti: "Parti kapatma iptidai bir ceza; ancak Türkiye gerçekleri karşısında bu uygulama korunmalıdır... Ben Türkiye'de orduyla polemiğe en çok giren siyasetçilerdenim. Ama şunu söyleyebilirim ki, Türk generallerinin ülkeyi yönetmek arzusu yok. Yönetmek isteyenler de ayıklanıyor. Ama bölücülük ve irtica tehlikesi devam ettiği sürece askerin kışlasına dönmesi beklenemez." Bu sözler üzerine Yılmaz, hem AP'de hem de Türkiye'de büyük tepki toplamıştı.