Askerî yargı emir-komuta içinde işler." diyen Petek, çağdaş ve evrensel hukuku savunan akademisyen ve uygulayıcıların askerî yargıyı bağımsız ve tarafsız kabul etmediğini belirtti.

AİHM'nin de Devlet Güvenlik Mahkemeleri'nin kararlarını bünyesinde askerî hakim olduğu için tarafsız bulmadığını hatırlatan Petek, yayın yasağının hukukî olmadığını söyledi. Petek'in konuyla ilgili görüşleri şöyle: "Yayın yasağında, 'Taraf gazetesinde yazılan bilgi içeriğine yönelik yayın yasağı' deniyor. Zaten bu bilgi yayınlandı. 'Yargı otoritesinin kamu düzeni gereği yayın yasağı konulmuştur.' deniyor. Yargının otoritesini sarsan bir durum yoktur. Genelkurmay tarafından yapılan soruşturma dosyasından alınmış bir belge değildir. Genelkurmay'ın başlattığı soruşturmanın akabinde böyle bir belge çıkmamıştır. Bir basın mensubu bunu almış yayınlamış. Yayınlanmış belgeye ilişkin yayın yasağı koymak hukukî değildir. Bu bilginin kim tarafından sızdırıldığından önce tamamen illegal çalışma içeren bilgi ve belgeyi kimin hazırladığı tespit edilerek, o kişilerin görevden alınıp yargıya teslim edilmesi gerekir. 'Hukuka ve demokrasiye saygılıyız.' diyen bir Genelkurmay Başkanı ile bu belgeyi hazırlayanların aynı yerde olması düşünülemez. Genelkurmay Başkanı bunu ortaya çıkarmazsa da, hükümet gereğini yapmalıdır."